Прямокутне полотнище складається з двох однакових горизонтальних смуг: блакитної і світло-зеленої. Прапор має й червоний рівнобічний трикутник (розміщений основою до древка) із золотисто-білим зображенням фортеці, що є елементом герба Полонного.
В одній з перших літописних згадок за 1234 рік Полонне описують містом «у лузі Хоморському». Зелений колір прапору – це луги та поля навколо річки Хомори, голубий – небо й вода. Так як давня історія Полонного пов’язана з Волинню, фоном для зображення фортеці вибрали червоний. Він переважає в геральдиці цього краю.
Такий прапор Полонне має з вересня 2016 року.